# Hierarchy For Package loci.formats.in

Package Hierarchies:

- All Packages

## Class Hierarchy

- java.lang.Object
  - java.util.AbstractMap<K,V> (implements java.util.Map<K,V>)
    - java.util.HashMap<K,V> (implements java.lang.Cloneable, java.util.Map<K,V>, java.io.Serializable)
      - loci.formats.in.PrairieMetadata.ValueTable (implements loci.formats.in.PrairieMetadata.Value)
  - loci.formats.in.AmiraReader.ASCII (implements loci.formats.in.AmiraReader.PlaneReader)
  - loci.formats.in.AmiraReader.HxRLE (implements loci.formats.in.AmiraReader.PlaneReader)
  - loci.formats.in.AmiraReader.HxZip (implements loci.formats.in.AmiraReader.PlaneReader)
  - loci.formats.in.APNGReader.PNGBlock
  - loci.formats.in.BaseZeissReader.Layer
  - loci.formats.in.BaseZeissReader.Shape
  - loci.formats.in.BaseZeissReader.Tag
  - loci.formats.in.BDVReader.H5Constants
  - loci.formats.in.BDVReader.H5Coordinate
  - loci.formats.in.BioRadReader.Note
  - loci.formats.in.CellH5Reader.CellH5Constants
  - loci.formats.in.CellH5Reader.CellH5Coordinate
  - loci.formats.in.CellomicsReader.ChannelFile
  - loci.formats.in.CellSensReader.Pyramid
  - loci.formats.in.CellSensReader.TileCoordinate
  - loci.formats.in.CellVoyagerReader.AreaInfo
  - loci.formats.in.CellVoyagerReader.ChannelInfo
  - loci.formats.in.CellVoyagerReader.FieldInfo
  - loci.formats.in.CellVoyagerReader.WellInfo
  - loci.formats.in.ColumbusReader.Plane
  - loci.formats.CoreMetadata (implements java.lang.Cloneable)
    - loci.formats.in.OMETiffReader.OMETiffCoreMetadata
    - loci.formats.in.SVSCoreMetadata
  - loci.formats.in.CV7000Reader.Channel
  - loci.formats.in.CV7000Reader.Field
  - loci.formats.in.CV7000Reader.LightSource
  - loci.formats.in.CV7000Reader.MinMax
  - loci.formats.in.CV7000Reader.Plane
  - org.xml.sax.helpers.DefaultHandler (implements org.xml.sax.ContentHandler, org.xml.sax.DTDHandler, org.xml.sax.EntityResolver, org.xml.sax.ErrorHandler)
    - loci.common.xml.BaseHandler
      - loci.formats.in.AFIReader.AFIHandler
      - loci.formats.in.BDVReader.BDVXMLHandler
      - loci.formats.in.BioRadReader.BioRadHandler
      - loci.formats.in.BioRadSCNReader.SCNHandler
      - loci.formats.in.ColumbusReader.MeasurementHandler
      - loci.formats.in.CV7000Reader.MeasurementDataHandler
      - loci.formats.in.CV7000Reader.MeasurementDetailHandler
      - loci.formats.in.CV7000Reader.MeasurementSettingsHandler
      - loci.formats.in.CV7000Reader.WPIHandler
      - loci.formats.in.FEITiffReader.FEIHandler
      - loci.formats.in.FlexReader.FlexHandler
      - loci.formats.in.FlexReader.MeaHandler
      - loci.formats.in.FlexReader.ResHandler
      - loci.formats.in.ImaconReader.ImaconHandler
      - loci.formats.in.InCellReader.InCellHandler
      - loci.formats.in.InCellReader.MinimalInCellHandler
      - loci.formats.in.IvisionReader.IvisionHandler
      - loci.formats.in.LeicaHandler
      - loci.formats.in.MetamorphHandler
      - loci.formats.in.MicromanagerReader.MicromanagerHandler
      - loci.formats.in.ND2Handler
      - loci.formats.in.OMEXMLReader.OMEXMLHandler
      - loci.formats.in.OperettaReader.OperettaHandler
      - loci.formats.in.ScanrReader.ScanrHandler
    - loci.formats.in.LeicaSCNReader.LeicaSCNHandler
    - loci.formats.in.ZeissTIFFHandler
  - loci.formats.in.DefaultMetadataOptions (implements loci.formats.in.MetadataOptions)
  - loci.formats.in.DeltavisionReader.DVExtHdrFields
  - loci.formats.in.DynamicMetadataOptions (implements loci.formats.in.MetadataOptions)
  - loci.formats.in.FakeReader.TextLine
  - loci.formats.in.FlexReader.FilterGroup
  - loci.formats.in.FlexReader.FlexFile
  - loci.formats.FormatHandler (implements loci.formats.IFormatHandler)
    - loci.formats.FormatReader (implements loci.formats.IFormatReader)
      - loci.formats.in.AFIReader
      - loci.formats.in.AIMReader
      - loci.formats.in.AliconaReader
      - loci.formats.in.AmiraReader
      - loci.formats.in.AnalyzeReader
      - loci.formats.in.APLReader
      - loci.formats.in.APNGReader
      - loci.formats.in.ARFReader
      - loci.formats.in.AVIReader
      - loci.formats.in.BaseZeissReader
        - loci.formats.in.ZeissTIFFReader
        - loci.formats.in.ZeissZVIReader
      - loci.formats.in.BDReader
      - loci.formats.in.BDVReader
      - loci.formats.in.BIFormatReader
        - loci.formats.in.ImageIOReader
          - loci.formats.in.JPEGReader.DefaultJPEGReader
        - loci.formats.in.MNGReader
        - loci.formats.in.TiffJAIReader
      - loci.formats.in.BioRadGelReader
      - loci.formats.in.BioRadReader
      - loci.formats.in.BioRadSCNReader
      - loci.formats.in.BMPReader
      - loci.formats.in.BrukerReader
      - loci.formats.in.BurleighReader
      - loci.formats.in.CanonRawReader
      - loci.formats.in.CellH5Reader
      - loci.formats.in.CellomicsReader
      - loci.formats.in.CellSensReader
      - loci.formats.in.CellVoyagerReader
      - loci.formats.in.CellWorxReader
        - loci.formats.in.MetaxpressTiffReader
      - loci.formats.in.ColumbusReader
      - loci.formats.in.CV7000Reader
      - loci.formats.in.DCIMGReader
      - loci.formats.DelegateReader
        - loci.formats.in.JPEGReader
        - loci.formats.in.TiffDelegateReader
      - loci.formats.in.DeltavisionReader
        - loci.formats.in.RCPNLReader
      - loci.formats.in.Ecat7Reader
      - loci.formats.in.EPSReader
      - loci.formats.in.FakeReader
      - loci.formats.in.FEIReader
      - loci.formats.in.FitsReader
      - loci.formats.in.FlexReader
      - loci.formats.in.FlowSightReader
      - loci.formats.in.FujiReader
      - loci.formats.in.FV1000Reader
      - loci.formats.in.GatanDM2Reader
      - loci.formats.in.GatanReader
      - loci.formats.in.GIFReader
      - loci.formats.in.HamamatsuVMSReader
      - loci.formats.in.HISReader
      - loci.formats.in.HitachiReader
      - loci.formats.in.HRDGDFReader
      - loci.formats.in.I2IReader
      - loci.formats.in.ICSReader
      - loci.formats.in.IM3Reader
      - loci.formats.in.ImagicReader
      - loci.formats.in.ImarisReader
      - loci.formats.in.IMODReader
      - loci.formats.in.ImspectorReader
      - loci.formats.in.InCell3000Reader
      - loci.formats.in.InCellReader
      - loci.formats.in.INRReader
      - loci.formats.in.InveonReader
      - loci.formats.in.IPLabReader
      - loci.formats.in.IPWReader
      - loci.formats.in.IvisionReader
      - loci.formats.in.JDCEReader
      - loci.formats.in.JEOLReader
      - loci.formats.in.JPEG2000Reader
      - loci.formats.in.JPXReader
      - loci.formats.in.KhorosReader
      - loci.formats.in.KLBReader
      - loci.formats.in.KodakReader
      - loci.formats.in.L2DReader
      - loci.formats.in.LeicaReader
      - loci.formats.in.LiFlimReader
      - loci.formats.in.LIFReader
      - loci.formats.in.LIMReader
      - loci.formats.in.LeicaMicrosystemsMetadata.LMSFileReader
        - loci.formats.in.LOFReader
        - loci.formats.in.XLEFReader
      - loci.formats.in.MIASReader
      - loci.formats.in.MicroCTReader
      - loci.formats.in.MicromanagerReader
      - loci.formats.in.MINCReader
      - loci.formats.in.MolecularImagingReader
      - loci.formats.in.MRCReader
      - loci.formats.in.MRWReader
      - loci.formats.in.NAFReader
      - loci.formats.in.NDPISReader
      - loci.formats.in.NiftiReader
      - loci.formats.in.NRRDReader
      - loci.formats.in.OBFReader
      - loci.formats.in.OIRReader
      - loci.formats.in.OlympusTileReader
      - loci.formats.in.OMEXMLReader
      - loci.formats.in.OpenlabRawReader
      - loci.formats.in.OpenlabReader
      - loci.formats.in.OperettaReader
      - loci.formats.in.OxfordInstrumentsReader
      - loci.formats.in.PCIReader
      - loci.formats.in.PCORAWReader
      - loci.formats.in.PCXReader
      - loci.formats.in.PDSReader
      - loci.formats.in.PerkinElmerReader
      - loci.formats.in.PGMReader
      - loci.formats.in.PictReader
      - loci.formats.in.PovrayReader
      - loci.formats.in.PQBinReader
      - loci.formats.in.PrairieReader
      - loci.formats.in.PSDReader
      - loci.formats.in.QTReader
      - loci.formats.in.QuesantReader
      - loci.formats.in.RHKReader
      - loci.formats.in.SBIGReader
      - loci.formats.in.ScanrReader
      - loci.formats.in.SDTReader
      - loci.formats.in.SeikoReader
      - loci.formats.in.SIFReader
      - loci.formats.in.SlideBook7Reader
      - loci.formats.in.SlidebookReader
      - loci.formats.in.SMCameraReader
      - loci.formats.in.SPCReader
      - loci.formats.in.SPEReader
      - loci.formats.in.SpiderReader
      - loci.formats.SubResolutionFormatReader
        - loci.formats.in.DicomReader
        - loci.formats.in.ImarisHDFReader
        - loci.formats.in.MinimalTiffReader
          - loci.formats.in.BaseTiffReader
            - loci.formats.in.DNGReader
            - loci.formats.in.FEITiffReader
            - loci.formats.in.FluoviewReader
            - loci.formats.in.GelReader
            - loci.formats.in.ImaconReader
            - loci.formats.in.ImarisTiffReader
            - loci.formats.in.ImprovisionTiffReader
            - loci.formats.in.IonpathMIBITiffReader
            - loci.formats.in.JPKReader
            - loci.formats.in.LeicaSCNReader
            - loci.formats.in.LEOReader
            - loci.formats.in.MetamorphReader
            - loci.formats.in.MetamorphTiffReader
            - loci.formats.in.NDPIReader
            - loci.formats.in.NikonElementsTiffReader
            - loci.formats.in.NikonReader
            - loci.formats.in.NikonTiffReader
            - loci.formats.in.PhotoshopTiffReader
            - loci.formats.in.PyramidTiffReader
            - loci.formats.in.SEQReader
            - loci.formats.in.SimplePCITiffReader
            - loci.formats.in.SISReader
            - loci.formats.in.SlidebookTiffReader
            - loci.formats.in.SVSReader
              - loci.formats.in.MikroscanTiffReader
            - loci.formats.in.TiffReader
            - loci.formats.in.TrestleReader
            - loci.formats.in.VectraReader
            - loci.formats.in.VentanaReader
        - loci.formats.in.ND2Reader
        - loci.formats.in.OMETiffReader
      - loci.formats.in.TargaReader
      - loci.formats.in.TCSReader
      - loci.formats.in.TecanReader
      - loci.formats.in.TextReader
      - loci.formats.in.TileJPEGReader
      - loci.formats.in.TillVisionReader
      - loci.formats.in.TissueFAXSReader
      - loci.formats.in.TopometrixReader
      - loci.formats.in.UBMReader
      - loci.formats.in.UnisokuReader
      - loci.formats.in.VarianFDFReader
      - loci.formats.in.VeecoReader
      - loci.formats.in.VGSAMReader
      - loci.formats.in.VisitechReader
      - loci.formats.in.VolocityClippingReader
      - loci.formats.in.VolocityReader
      - loci.formats.in.WATOPReader
      - loci.formats.WrappedReader
        - loci.formats.in.FilePatternReader
      - loci.formats.in.ZeissCZIReader
      - loci.formats.in.ZeissLMSReader
      - loci.formats.in.ZeissLSMReader
      - loci.formats.in.ZeissXRMReader
      - loci.formats.in.ZipReader
  - loci.formats.in.FV1000Reader.ChannelData
  - loci.formats.in.FV1000Reader.PlaneData
  - loci.formats.in.GatanReader.ROIShape
  - loci.formats.in.IM3Reader.IM3Record
    - loci.formats.in.IM3Reader.BooleanIM3Record
    - loci.formats.in.IM3Reader.ContainerRecord
    - loci.formats.in.IM3Reader.FloatIM3Record
    - loci.formats.in.IM3Reader.IntIM3Record
    - loci.formats.in.IM3Reader.StringIM3Record
  - loci.formats.in.IM3Reader.Spectrum
  - loci.formats.in.InCellReader.Image
  - java.io.InputStream (implements java.io.Closeable)
    - loci.formats.in.APNGReader.PNGInputStream
  - loci.formats.in.JDCEReader.PlaneMetadata
  - loci.formats.in.JPEG2000MetadataParser
  - loci.formats.in.LeicaHandler.Channel
  - loci.formats.in.LeicaHandler.Detector
  - loci.formats.in.LeicaHandler.Laser
  - loci.formats.in.LeicaHandler.MultiBand
  - loci.formats.in.LeicaHandler.ROI
  - loci.formats.in.LeicaReader.Detector
  - loci.formats.in.LeicaSCNReader.Dimension
  - loci.formats.in.LeicaSCNReader.Image
  - loci.formats.in.LeicaSCNReader.ImageCollection
  - loci.formats.in.LeicaSCNReader.Pixels
  - loci.formats.in.LiFlimReader.ROI
  - loci.formats.in.LIFReader.MemoryBlock
  - loci.formats.in.LIFReader.ROI
  - loci.formats.in.LIPixelFormat
  - loci.formats.in.MetamorphTiffReader.NumericComparator (implements java.util.Comparator<T>)
  - loci.formats.in.MetamorphTiffReader.Well
  - loci.formats.in.MIASReader.AnalysisFile
  - loci.formats.in.MicromanagerReader.Index
  - loci.formats.in.MicromanagerReader.Position
  - loci.formats.in.MNGReader.SeriesInfo
  - loci.formats.in.ND2Reader.ChunkMapEntry
  - loci.formats.in.OBFReader.Stack
  - loci.formats.in.OBFReader.State
  - loci.formats.in.OIRReader.Channel
  - loci.formats.in.OIRReader.CZTKey
  - loci.formats.in.OIRReader.Detector
  - loci.formats.in.OIRReader.Laser
  - loci.formats.in.OIRReader.Objective
  - loci.formats.in.OIRReader.PixelBlock
  - loci.formats.in.OlympusTileReader.Tile (implements java.lang.Comparable<T>)
  - loci.formats.in.OMETiffReader.OMETiffPlane
  - loci.formats.in.OMEXMLReader.BinData
  - loci.formats.in.OpenlabReader.PlaneInfo
  - loci.formats.in.OperettaReader.Channel
  - loci.formats.in.OperettaReader.Plane
  - loci.formats.in.PerkinElmerReader.PixelsFile
  - loci.formats.in.PrairieMetadata
  - loci.formats.in.PrairieMetadata.Frame
  - loci.formats.in.PrairieMetadata.PFile
  - loci.formats.in.PrairieMetadata.Sequence
  - loci.formats.in.PrairieMetadata.ValueItem (implements loci.formats.in.PrairieMetadata.Value)
  - loci.formats.in.SDTInfo
  - loci.formats.in.SlideBook7Reader.CCompressionBase
  - loci.formats.in.SlideBook7Reader.CImageData
  - loci.formats.in.SlideBook7Reader.CImageGroup.CAnnotations
  - loci.formats.in.SlideBook7Reader.CImageGroup.CAuxDoubleData
  - loci.formats.in.SlideBook7Reader.CImageGroup.CAuxFloatData
  - loci.formats.in.SlideBook7Reader.CImageGroup.CAuxSInt32Data
  - loci.formats.in.SlideBook7Reader.CImageGroup.CAuxSInt64Data
  - loci.formats.in.SlideBook7Reader.CImageGroup.CAuxXmlData
  - loci.formats.in.SlideBook7Reader.CImageGroup.CMaskPositions
  - loci.formats.in.SlideBook7Reader.ClassDecoder
    - loci.formats.in.SlideBook7Reader.CAlignManipRecord70
    - loci.formats.in.SlideBook7Reader.CAnnotation70
    - loci.formats.in.SlideBook7Reader.CChannelDef70
    - loci.formats.in.SlideBook7Reader.CChannelRecord70
    - loci.formats.in.SlideBook7Reader.CCube
    - loci.formats.in.SlideBook7Reader.CCubeAnnotation70
    - loci.formats.in.SlideBook7Reader.CDataTableHeaderRecord70
    - loci.formats.in.SlideBook7Reader.CExposureRecord70
    - loci.formats.in.SlideBook7Reader.CFluorDef70
    - loci.formats.in.SlideBook7Reader.CFRAPRegionAnnotation70
    - loci.formats.in.SlideBook7Reader.CFRETManipRecord70
    - loci.formats.in.SlideBook7Reader.CHistogramRecord70
    - loci.formats.in.SlideBook7Reader.CImageGroup
    - loci.formats.in.SlideBook7Reader.CImageRecord70
    - loci.formats.in.SlideBook7Reader.CLensDef70
    - loci.formats.in.SlideBook7Reader.CMainViewRecord70
    - loci.formats.in.SlideBook7Reader.CMaskRecord70
    - loci.formats.in.SlideBook7Reader.COptovarDef70
    - loci.formats.in.SlideBook7Reader.CRatioManipRecord70
    - loci.formats.in.SlideBook7Reader.CRemapChannelLUT70
    - loci.formats.in.SlideBook7Reader.CRemapManipRecord70
    - loci.formats.in.SlideBook7Reader.CRemapPoint
    - loci.formats.in.SlideBook7Reader.CSlideRecord70
    - loci.formats.in.SlideBook7Reader.CUnknownAnnotation70
  - loci.formats.in.SlideBook7Reader.CNpyHeader
  - loci.formats.in.SlideBook7Reader.CSBFile70
  - loci.formats.in.SlideBook7Reader.CSBPoint<T>
  - loci.formats.in.SlideBook7Reader.DataLoader
  - loci.formats.in.SlideBook7Reader.IntIntPair
  - loci.formats.in.SlideBook7Reader.StrIntPair
  - loci.formats.in.SPEReader.SpeHeader
  - loci.formats.in.SPEReader.SpeROI
  - loci.formats.in.TecanReader.Channel
  - loci.formats.in.TecanReader.Image
  - loci.formats.in.TissueFAXSReader.Channel
  - loci.formats.in.TissueFAXSReader.ScanRegion
  - loci.formats.in.VentanaReader.AreaOfInterest
  - loci.formats.in.VentanaReader.Overlap (implements java.lang.Comparable<T>)
  - loci.formats.in.VentanaReader.TIFFTile
  - loci.formats.in.VolocityReader.Stack
  - loci.formats.internal.WellContainer (implements java.lang.Comparable<T>)
    - loci.formats.in.JDCEReader.JDCEWell
  - loci.formats.in.XLEFReader.PathComparator (implements java.util.Comparator<T>)
  - loci.formats.in.ZeissCZIReader.AttachmentEntry
  - loci.formats.in.ZeissCZIReader.Channel
  - loci.formats.in.ZeissCZIReader.Coordinate
  - loci.formats.in.ZeissCZIReader.DimensionEntry
  - loci.formats.in.ZeissCZIReader.DirectoryEntry
  - loci.formats.in.ZeissCZIReader.Segment
    - loci.formats.in.ZeissCZIReader.Attachment
    - loci.formats.in.ZeissCZIReader.AttachmentDirectory
    - loci.formats.in.ZeissCZIReader.Directory
    - loci.formats.in.ZeissCZIReader.FileHeader
    - loci.formats.in.ZeissCZIReader.Metadata
    - loci.formats.in.ZeissCZIReader.SubBlock
  - loci.formats.in.ZeissLSMReader.SubBlock
    - loci.formats.in.ZeissLSMReader.BeamSplitter
    - loci.formats.in.ZeissLSMReader.DataChannel
    - loci.formats.in.ZeissLSMReader.DetectionChannel
    - loci.formats.in.ZeissLSMReader.IlluminationChannel
    - loci.formats.in.ZeissLSMReader.Laser
    - loci.formats.in.ZeissLSMReader.Marker
    - loci.formats.in.ZeissLSMReader.Recording
    - loci.formats.in.ZeissLSMReader.Timer
    - loci.formats.in.ZeissLSMReader.Track
  - loci.formats.in.ZeissTIFFHandler.Plane
  - loci.formats.in.ZeissTIFFHandler.Scaling
  - loci.formats.in.ZeissTIFFHandler.Scaling.Dimension
  - loci.formats.in.ZeissTIFFHandler.Tag
  - loci.formats.in.ZeissTIFFHandler.TagSet
  - loci.formats.in.ZeissTIFFReader.Plane
  - loci.formats.in.ZeissTIFFReader.TIFFInfo

## Interface Hierarchy

- loci.formats.in.AmiraReader.PlaneReader
- loci.formats.in.MetadataOptions
- loci.formats.in.PrairieMetadata.Value

## Enum Hierarchy

- java.lang.Object
  - java.lang.Enum<E> (implements java.lang.Comparable<T>, java.io.Serializable)
    - loci.formats.in.SPEReader.SpeHeaderType
    - loci.formats.in.SPEReader.SpeHeaderEntry
    - loci.formats.in.LOFReader.MetadataSource
    - loci.formats.in.BaseZeissReader.Context
    - loci.formats.in.BaseZeissReader.FeatureType
    - loci.formats.in.BaseZeissReader.DrawStyle
    - loci.formats.in.BaseZeissReader.FillStyle
    - loci.formats.in.BaseZeissReader.LineEndStyle
    - loci.formats.in.BaseZeissReader.PointStyle
    - loci.formats.in.BaseZeissReader.LineEndPositions
    - loci.formats.in.BaseZeissReader.TextAlignment
    - loci.formats.in.BaseZeissReader.Charset
    - loci.formats.in.SlideBook7Reader.EGraphicType
    - loci.formats.in.MetadataLevel

Copyright © 2026 Open Microscopy Environment